MBC 창사기념 특별기획 드라마로, 1999년 11월 22일부터 2000년 6월 27일까지 방영되었다. 조선시대 최고의 명의 허준의 삶을 그린 이은성의 《소설 동의보감》을 원작으로 했으며, 사극의 거장 이병훈 PD와 허준 역의 전광렬, 유의태 역의 이순재를 비롯 여러 주-조연들의 뛰어난 연기로 극의 재미를 더했다.
1592년 일본이 대군을 이끌고 조선을 침략하면서 임진왜란이 일어났다. 초기에 한양과 평양이 함락되었으나, 이순신의 수군과 각지의 의병, 명의 지원군이 활약하여 1598년 일본군을 물리쳤다.
1608년 광해군이 조선의 제15대 왕으로 즉위하였다. 그는 전쟁의 피해를 복구하고 대동법을 실시하였으며 명과 후금 사이에서 중립 외교를 폈으나, 인조반정으로 왕위에서 쫓겨났다.